В Оренбургской области на 1 декабря 2011 года работало 666,5 сотрудников таможни. В связи с проведением организационно-штатных мероприятий в таможенных органах, расположенных на российско-казахстанской границе штатная численность таможни сокращена на 544 человека (45%). Она отметила, что с 1 июля ликвидировано шесть таможенных постов, расположенных на российско-казахстанской государственной границе, отдел применения инспекционно-досмотровых комплексов, значительно сокращены должности правоохранительного блока, специального отряда быстрого реагирования.
Кроме этого, в связи с уходом таможенников с границы и ликвидацией таможенных постов Оренбургской таможней проведена большая работа по передаче имущества закрытых таможенных объектов на баланс сторонним организациям. Управлению Федеральной службы судебных приставов по Оренбургской области переданы объекты таможенного поста ДАПП «Комсомольский» общей стоимостью 1,050 млн рублей, а также административное здание таможенного поста ДАПП «Светлый» на сумму 305 тыс. рублей. В мае 2011 года на баланс Муниципальному образованию Восточный сельсовет Светлинского района переданы земельный участок и имущество автомобильного пункта пропуска ДАПП «Восточный» на сумму 18,497 млн рублей. В октябре 2011 года проведена работа по передаче имущества закрытого автомобильного пункта пропуска "Союзное" на баланс Муниципального образования Ясненский район Оренбургской области, стоимость переданного имущества составила 13,205 млн рублей.
С 15 декабря в таможне на базе Оренбургского магистрального сортировочного центра начал функционировать Оренбургский почтовый таможенный пост.
Штатная численность таможенного поста составляет 52 человека.